Ο κύριος κορμός της Βιβλιοθήκης πλαισιώνεται και από ειδικές συλλογές.
Η συλλογή Αθανάσιου Δ. Χατζηδήμου, που αποτελείται από σμυρναϊκές εκδόσεις του 19ου αιώνα, αγοράστηκε το 1980 και καταγράφηκε από την ερευνήτρια Ιωάννα Πετροπούλου.
Η συλλογή Χριστόφορου Ι. Χρηστίδη, δωρεά της ανιψιάς του, κυρίας Ιωάννας Αγιάνογλου, καταγράφηκε από την ερευνήτρια Ματούλα Κουρουπού. Αποτελείται από εκδόσεις ελληνικές και ξενόγλωσσες, που τυπώθηκαν στην Κωνσταντινούπολη ή αναφέρονται σε αυτήν. Η συλλογή περιλαμβάνει και σημαντική σειρά τουρκικών βιβλίων και περιοδικών.
Επίσης, 500 περίπου καταστατικά συλλόγων και οργανώσεων από την Κωνσταντινούπολη και τη Μικρά Ασία συγκεντρώθηκαν με δωρεές όπως του Φολεγάνδριου Δ. Μ. Μοστράτου. Συμπληρώθηκαν και βιβλιογραφήθηκαν από την ερευνήτρια Ματούλα Κουρουπού.